• وحدة الميكروسكوب الإلكتروني بمعهد البحوث الطبية

• وحدة المناعة وزرع الخلايا بمعهد البحوث الطبية

• وحدة البيولوجيا الجزيئية بمعهد البحوث الطبية

• وحدة الامتصاص الذرى بمعهد البحوث الطبية

• بيت الحيوان بمعهد البحوث الطبية

• مركز صحة المرأة بمعهد البحوث الطبية

• وحدة علاج الالم بمعهد البحوث الطبية

• وحدة الحوكمة الصحية بمعهد البحوث الطبية

• مركز الإسكندرية للآثار البحرية والتراث الثقافي الغارق (كلية الآداب)

• مركز دراسات حوض النيل (كلية الآداب)

• مركز تعليم اللغة العربية كلغة أجنبية – TAFL)) – (كلية الآداب)

• مركز التجارب السريرية (كلية الطب)

• مركز ابحاث الخلايا الجذعية (كلية الطب)

• هندسة الأنسجة

• مركز تقنية النانو (كلية العلوم)

• مركز التنمية المستدامة (كلية التربية)

• مركز الطاقة المتجددة بجامعة الاسكندرية
• مراكز التميز بمعهد الدراسات العليا والبحوث
• معمل البيولوجيا الجزيئية (كلية العلوم)
• معمل الفيزياء الاشعاعية (كلية العلوم)
• معمل زراعة الانسجة البيولوجية (كلية العلوم)
• معمل التآكل 
• معامل كلية الطب